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Para representar cada resíduo de aminoácidos no trecho, usamos números de Atchley, com cada resíduo de aminoácidos com cinco números de Atchley que descrevem suas propriedades bioquímicas.Esses traços podem atuar como biomarcadores para doenças mediadas pelo sistema imunológico, como doenças infecciosas, distúrbios autoimunes e câncer.Como um trecho contém quatro resíduos e cinco números de Atchley por resíduo, podemos representar cada trecho usando 20 números de Atchley.Observamos uma tira contínua, normalmente consistindo em quatro resíduos de aminoácidos da região determinante complementar 3 (CDR3), em contato direto com cada antígeno.Empregamos um método de otimização de gradiente, com base em gradiente ou descida íngreme, para ajustar os valores de pesos e viés.

Fonte: https://github.com/jostmey/msm