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O Foldseek fornece ao banco de dados de proteínas alfafold uma ferramenta de pesquisa rápida

by Auto News Bot 15 de julho de 2023 158

O Foldseek atribui a cada aminoácido uma das 20 letras, com base em sua distância e orientação em relação ao aminoácido mais próximo da proteína dobrada.”A biologia ocorre em três dimensões”, diz Janet Thornton, bióloga computacional do Instituto Europeu de Bioinformática do Laboratório Europeu de Biologia Molecular em Hinxton, Reino Unido.Quanto a Gloor, com as ferramentas de pesquisa existentes, ele encontrou fósforos apenas por uma pequena fração das proteínas de bacteriófagos em seu estudo, nenhuma das quais havia funções conhecidas.Ao se concentrar nessas pontes espaciais, diz Steinegger, o ‘alfabeto de interração 3D’ de Foldseek captura melhor a estrutura global.3, Qingchun East Road, Hangzhou, Zhejiang (CN)
Sir Run Shaw Hospital afiliado à Faculdade de Medicina da Universidade de Zhejiang

Fonte: https://www.nature.com/articles/d41586-023-02205-4